La Fondation Custodia gère une riche collection d’estampes, rassemblées au cours du XXe siècle. D’une rare exigence dans ses acquisitions, Frits Lugt prenait soin de choisir des tirages exceptionnels. Essentiellement composée d’estampes d’artistes hollandais et flamands des XVIe et XVIIe siècles, parmi lesquelles se trouvent d’innombrables paysages, la collection s’est construite autour de quelques noyaux importants qui reflètent le goût de Lugt. Elle comprend par exemple un fonds important de portraits gravés, dont des chefs-d’œuvre de Robert Nanteuil (1623-1678), ainsi que la célèbre série de portraits qui forme l’Iconographie d’Anthony van Dyck (1599-1641).