La Fondation Custodia gère une riche collection d’estampes, rassemblées au cours du XX^e siècle. D’une rare exigence dans ses acquisitions, Frits Lugt prenait soin de choisir des tirages exceptionnels. Essentiellement composée d’estampes d’artistes hollandais et flamands des XVI^e et XVII^e siècles, parmi lesquelles se trouvent d’innombrables paysages, la collection s’est construite autour de quelques noyaux importants qui reflètent le goût de Lugt. Elle comprend par exemple un fonds important de portraits gravés, dont des chefs-d’œuvre de Robert Nanteuil (1623-1678), ainsi que la célèbre série de portraits qui forme l’Iconographie d’Anthony van Dyck (1599-1641).

Les chiaroscuri – gravures sur bois imprimées en couleurs – de maîtres italiens, allemands et néerlandais représentent aussi une riche section de la collection. En outre, Lugt a acquis des estampes du XIX^e et du XX^e siècle, s’intéressant surtout aux aquafortistes qui s’inspirent de Rembrandt comme par exemple Sir Francis Seymour Haden (1818-1910). La collection compte également quelques recueils d’estampes ainsi que des albums constitués par des collectionneurs.

Certains artistes sont particulièrement bien représentés dans la collection, à commencer par Rembrandt (1606/07-1669) dont la Fondation Custodia possède la quasi-totalité de l’œuvre gravé dans des épreuves de grande qualité. Les très rares estampes de Lucas van Leyden (1494-1533), celles de Wenzel Hollar (1607-1677), Jacques Callot (1592-1635) et Adriaen van Ostade (1610-1685) ont également une place de choix dans ce fonds. Lugt y révèle sa prédilection pour les estampes originales, autrement dit celles réalisées par des peintres-graveurs : des artistes qui exécutaient eux-mêmes leurs projets de gravure. À l’exception des portraits et des chiaroscuri, il acquit peu d’estampes de reproduction.

Réunissant près de 15 000 estampes, la collection Frits Lugt s’enrichit continuellement de nouvelles acquisitions qui viennent compléter les ensembles existants, ou sont liées à d’autres œuvres de la Fondation – dessins, tableaux, lettres, … Un certain nombre de feuilles maniéristes, jusqu’ici sous-représentées, ont récemment fait leur entrée, de même qu’un petit ensemble de gravures danoises du XIX^e siècle. La Fondation Custodia s’intéresse aussi aux aquafortistes contemporains influencés par les eaux-fortes hollandaises du XVII^e siècle. Elle possède ainsi l’œuvre presque complet du Néerlandais Frans Pannekoek (né en 1937).